Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC9Q9UKV0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms