Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARP4Q9UKK3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP4Q9UKK3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms