Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms