Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD1Q9UIS9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms