Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF639Q9UID6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms