Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CYTH4Q9UIA0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms