Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NPC1L1Q9UHC9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms