Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms