Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms