Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN3Q9P1Z3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms