Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf109Q9NX04 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf109Q9NX04 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf109Q9NX04 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf109Q9NX04 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf109Q9NX04 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf109Q9NX04 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf109Q9NX04 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf109Q9NX04 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf109Q9NX04 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C1orf109Q9NX04 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C1orf109Q9NX04 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms