Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ASF1BQ9NVP2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ASF1BQ9NVP2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms