Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT82Q9NSB4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms