Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB6BQ9NRW1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms