Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

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Length 84 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CDC42SE2Q9NRR3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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