Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRIP3Q9NQ35 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms