Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA4BQ9NPR2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms