Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4GALTQ9NPC4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms