Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms