Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
VTA1Q9NP79 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms