Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms