Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAP2

MLXIP, MLX-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLXIPQ9HAP2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MLXIPQ9HAP2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms