Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF1DQ9H5J8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1DQ9H5J8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms