Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6AQ9H2E6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms