Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF541Q9H0D2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms