Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C20orf27Q9GZN8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms