Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms