Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms