Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT23Q9C075 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms