Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms