Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM54Q9BYV2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms