Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms