Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN1Q9BY11 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms