Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL3Q9BXA9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms