Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP1Q9BWH6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms