Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms