Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MCMBPQ9BTE3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms