Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDF4Q9BRK5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms