Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms