Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms