Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms