Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RGPD5Q99666 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms