Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EYA3Q99504 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms