Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms