Protein–RNA interactions for Protein: Q96S16

JMJD8, JmjC domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8Q96S16 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
JMJD8Q96S16 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms