Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A9Q96Q91 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms