Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CR12Q96Q35 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms