Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNGAP1Q96PV0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGAP1Q96PV0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms