Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM20AQ96MK3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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