Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q96MF0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q96MF0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q96MF0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q96MF0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96MF0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96MF0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96MF0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96MF0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96MF0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96MF0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96MF0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96MF0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96MF0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96MF0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96MF0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96MF0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96MF0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96MF0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96MF0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96MF0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96MF0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96MF0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96MF0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96MF0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96MF0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96MF0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q96MF0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q96MF0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q96MF0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q96MF0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q96MF0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q96MF0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q96MF0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q96MF0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q96MF0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q96MF0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q96MF0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q96MF0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q96MF0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q96MF0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q96MF0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q96MF0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q96MF0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q96MF0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q96MF0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q96MF0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q96MF0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96MF0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms